В первом полугодии 2013-го года мы ожидаем выход JIRA 6. Информируем о том, что начиная с этой версии более не будет возможности сконфигурировать собственный формат ключа проекта JIRA. Это связано с большим количеством ошибок в сторонних плагинах, исключить которые можно только унифицировав формат ключа проекта. Если вы задали в своей системе уникальные форматы ключей проекта - спланируейте в ближайшие полгода возвраз их к стандартному формату.